Aineen Kuvataidesäätiön ja Tornion kaupungin välisen sopimuksen mukaisesti perusnäyttely ripustetaan neljään saliin. Näyttely vaihtuu vuosittain. Perusnäyttelyyn otetaan teoksia kaikista Aineen taidemuseossa olevista kokoelmista ja joskus lainataan myös ulkopuolelta. Perusnäyttelystä on muodostunut keskeisin runko taidemuseon tehtävissä. Perusnäyttely pohjautuu tutkimukseen ja heijastelee ajankohtaisia aiheita ja kysymyksiä.
Aineen taidemuseon vaihtuvat näyttelyt syventävät näkemystä taidemuseon omiin kokoelmiin ja alueelliseen taiteeseen. Vaihtuvat näyttelyt voidaan koota omista kokoelmista tai ne voivat olla talon ulkopuolelta tulevia kokoelmia, kutsuttuja taiteilijoita tai taiteilijaryhmiä.
Vuonna 2022 Aineen taidemuseo on suljettuna Rajakartanon remontin vuoksi. Näyttelytoimintaa kuitenkin järjestetään ympäri vuoden eri puolilla Tornion kaupunkia.
1.10.2021–31.10.2022 Ajan ja kulttuurin kerroksia Taidetta Aineen taidemuseon kokoelmista Tornion kaupungintalossa
11.5.2022 Sinun maailmanperintösi Werner Holmberg: Juhannusyö Torniossa (n. 1849, öljy kankaalle) Struve-tapahtuma, Alatornion kirkko
12.5.–28.8.2022 Väylän väki Kokoelmanäyttely Tornionjokilaaksosta ja sen taiteilijoista Kauppakeskus Rajalla
Syksy 2022 TILAA TAITEILIJUUTEEN, näyttely- ja residenssihanke yhteistyössä Yhdenvertaisen kulttuurin puolesta ry
Syksy 2022 STRUVEN AIKAMATKASSA yhteistyössä Struve-hanke, Lapin AMK